Normalde olmaması gereken yerde yerleşip gelişen endometrium dokusu, bazı kişilerde hiç sorun yaratmaz ya da çok az şikayete neden olurken, bazılarında  ise şiddetli ağrılara ve gebe kalmakta zorluklara neden olabilir.

 En sık görülen şikayetler şunlardır:
  1. Alt karın ve bel ağrısı: Bu ağrılar, menstruasyon (adet) öncesinde veya menstruasyon sırasında (dismenore) ya da herhangi bir zamanda olabilir. Süresi ve şiddeti kişiden kişiye değişir.
  2. Cinsel ilişki sırasında ağrı
  3. Odakların yerleştiği yere bağlı olarak, idrar yaparken ya da barsak hareketleri sırasında ağrı
  4. Gebe kalmada zorluk
  5. Yumurtalıklarda yerleştiğinde kist oluşması (çikolata kisti)