Myomektomi ameliyatında komplikasyon ile karşılaşılması nadirdir. 
Bunlar:
• Aşırı kanama
• Aşırı kan kaybına bağlı kansızlık ve/veya kan transfüzyonu ihtiyacı
• Cerrahi yara enfeksiyonu
• Cerrahi sırasında rahim veya barsakların yaralanması/delinmesi
• Büyük bir myomun çıkarılması sonrası rahim duvarında güçsüzlük
• Anesteziye bağlı sorunlar
• Sonrasında sezaryen ile doğum zorunluluğu
• Ağrı ve/veya barsak tıkanıklığına yol açan yapışıklıklar
• Aşırı derecede yapışıklık olmasına bağlı kısırlık problemleri
• Cerrahi sırasında kanser belirtilerinin saptanması ve rahimin çıkarılma zorunluluğu olması
• Myomların tekrar oluşması